MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y chromosome

Total Repeats: 85912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015580	GGC	2	6	26	31	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015580	GAG	2	6	139	144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015580	TTGA	2	8	179	186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015580	CAT	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015580	T	7	7	315	321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015580	CCT	2	6	348	353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334139602
7	NC_015580	CGC	2	6	489	494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139602
8	NC_015580	CCG	2	6	519	524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139602
9	NC_015580	TCG	2	6	635	640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139602
10	NC_015580	CTCG	2	8	717	724	0 %	25 %	25 %	50 %	334139602
11	NC_015580	ATC	2	6	859	864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139602
12	NC_015580	TCG	2	6	872	877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139602
13	NC_015580	CGGC	2	8	911	918	0 %	0 %	50 %	50 %	334139602
14	NC_015580	TCG	2	6	1007	1012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139602
15	NC_015580	ATC	2	6	1045	1050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139602
16	NC_015580	GA	3	6	1070	1075	50 %	0 %	50 %	0 %	334139602
17	NC_015580	GCC	2	6	1081	1086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139602
18	NC_015580	CGA	2	6	1122	1127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139602
19	NC_015580	CG	4	8	1149	1156	0 %	0 %	50 %	50 %	334139602
20	NC_015580	CTG	3	9	1198	1206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139602
21	NC_015580	GTC	2	6	1265	1270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139602
22	NC_015580	CTG	2	6	1333	1338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139602
23	NC_015580	GAAG	2	8	1377	1384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015580	GTG	2	6	1408	1413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015580	ACC	2	6	1436	1441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139603
26	NC_015580	CAT	2	6	1465	1470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139603
27	NC_015580	TCT	2	6	1479	1484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139603
28	NC_015580	TAC	2	6	1514	1519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139603
29	NC_015580	ATC	2	6	1524	1529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139603
30	NC_015580	AGG	2	6	1554	1559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139603
31	NC_015580	ATC	2	6	1595	1600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139603
32	NC_015580	GCTG	2	8	1674	1681	0 %	25 %	50 %	25 %	334139603
33	NC_015580	TCG	2	6	1698	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139603
34	NC_015580	GGCT	2	8	1724	1731	0 %	25 %	50 %	25 %	334139603
35	NC_015580	AAG	2	6	1745	1750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139603
36	NC_015580	CTG	2	6	1793	1798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139603
37	NC_015580	TGC	2	6	1816	1821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139603
38	NC_015580	ATC	2	6	1826	1831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139603
39	NC_015580	GTC	2	6	1832	1837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139603
40	NC_015580	TGG	2	6	1839	1844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139603
41	NC_015580	ATG	2	6	1875	1880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015580	ACC	2	6	1973	1978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015580	GCCG	2	8	2040	2047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015580	CAAG	2	8	2073	2080	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015580	GAA	2	6	2098	2103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139604
46	NC_015580	CGA	2	6	2160	2165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139604
47	NC_015580	GCC	2	6	2169	2174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139604
48	NC_015580	ATC	2	6	2225	2230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139604
49	NC_015580	GAC	2	6	2309	2314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139604
50	NC_015580	TGA	2	6	2427	2432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139604
51	NC_015580	GTG	2	6	2456	2461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139604
52	NC_015580	CGC	2	6	2490	2495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139604
53	NC_015580	CGA	2	6	2503	2508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139604
54	NC_015580	TCG	2	6	2607	2612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139604
55	NC_015580	CGC	2	6	2613	2618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139604
56	NC_015580	TGC	3	9	2637	2645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139604
57	NC_015580	CTG	2	6	2690	2695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139604
58	NC_015580	TGC	2	6	2697	2702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139604
59	NC_015580	TCG	2	6	2703	2708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139604
60	NC_015580	GAA	2	6	2720	2725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139604
61	NC_015580	CGA	2	6	2776	2781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139604
62	NC_015580	TCG	2	6	2838	2843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139604
63	NC_015580	GTC	2	6	2858	2863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139604
64	NC_015580	CTCGA	2	10	2870	2879	20 %	20 %	20 %	40 %	334139604
65	NC_015580	CTCGG	2	10	2883	2892	0 %	20 %	40 %	40 %	334139604
66	NC_015580	ACA	2	6	2901	2906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334139604
67	NC_015580	CGT	2	6	2908	2913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139604
68	NC_015580	CGG	2	6	2938	2943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139604
69	NC_015580	CTT	2	6	2977	2982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139604
70	NC_015580	CGGCG	2	10	2983	2992	0 %	0 %	60 %	40 %	334139604
71	NC_015580	GAG	2	6	3002	3007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139604
72	NC_015580	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139604
73	NC_015580	ATC	2	6	3023	3028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139604
74	NC_015580	GCT	2	6	3187	3192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139604
75	NC_015580	CGATG	2	10	3259	3268	20 %	20 %	40 %	20 %	334139604
76	NC_015580	CTT	2	6	3313	3318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139604
77	NC_015580	TGA	2	6	3369	3374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139605
78	NC_015580	TTG	2	6	3378	3383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334139605
79	NC_015580	GCA	2	6	3418	3423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139605
80	NC_015580	GGC	2	6	3454	3459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139605
81	NC_015580	TGC	2	6	3466	3471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139605
82	NC_015580	TGA	2	6	3486	3491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139605
83	NC_015580	CTG	3	9	3497	3505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139605
84	NC_015580	GC	3	6	3531	3536	0 %	0 %	50 %	50 %	334139605
85	NC_015580	GGC	2	6	3538	3543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139605
86	NC_015580	AAG	2	6	3566	3571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139605
87	NC_015580	ATCGGT	2	12	3581	3592	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334139605
88	NC_015580	GCT	2	6	3637	3642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139605
89	NC_015580	CTG	2	6	3674	3679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139605
90	NC_015580	GCG	2	6	3735	3740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139605
91	NC_015580	GC	3	6	3872	3877	0 %	0 %	50 %	50 %	334139605
92	NC_015580	TCG	2	6	3897	3902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139605
93	NC_015580	CTG	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139605
94	NC_015580	CGT	2	6	3916	3921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139605
95	NC_015580	ATC	2	6	3944	3949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139605
96	NC_015580	GAT	2	6	4021	4026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139605
97	NC_015580	TC	4	8	4062	4069	0 %	50 %	0 %	50 %	334139605
98	NC_015580	CG	3	6	4126	4131	0 %	0 %	50 %	50 %	334139606
99	NC_015580	GGC	2	6	4231	4236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139606
100	NC_015580	TGGCG	2	10	4255	4264	0 %	20 %	60 %	20 %	334139606
101	NC_015580	GCC	2	6	4303	4308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139606
102	NC_015580	CGG	2	6	4333	4338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139606
103	NC_015580	CAT	2	6	4369	4374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139606
104	NC_015580	CGC	3	9	4379	4387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139606
105	NC_015580	AGGC	2	8	4388	4395	25 %	0 %	50 %	25 %	334139606
106	NC_015580	GCA	2	6	4415	4420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139606
107	NC_015580	CGT	2	6	4428	4433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139606
108	NC_015580	AG	3	6	4501	4506	50 %	0 %	50 %	0 %	334139606
109	NC_015580	CGC	2	6	4608	4613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139606
110	NC_015580	GCG	2	6	4706	4711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139606
111	NC_015580	ATG	2	6	4763	4768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139606
112	NC_015580	CCG	2	6	4787	4792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139606
113	NC_015580	TCCG	2	8	4857	4864	0 %	25 %	25 %	50 %	334139606
114	NC_015580	TCG	2	6	4898	4903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139606
115	NC_015580	GTA	2	6	4918	4923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139606
116	NC_015580	TCC	2	6	5000	5005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334139606
117	NC_015580	CCA	2	6	5024	5029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139606
118	NC_015580	ATC	2	6	5042	5047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139606
119	NC_015580	GGT	2	6	5056	5061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015580	CGG	2	6	5097	5102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139607
121	NC_015580	TCG	2	6	5196	5201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139607
122	NC_015580	GTC	2	6	5345	5350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139607
123	NC_015580	CA	3	6	5432	5437	50 %	0 %	0 %	50 %	334139607
124	NC_015580	GC	4	8	5457	5464	0 %	0 %	50 %	50 %	334139607
125	NC_015580	CGA	2	6	5569	5574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139607
126	NC_015580	TGC	2	6	5642	5647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139607
127	NC_015580	CGA	3	9	5671	5679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139607
128	NC_015580	ATC	2	6	5706	5711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139607
129	NC_015580	AGC	2	6	5811	5816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139607
130	NC_015580	GC	3	6	5882	5887	0 %	0 %	50 %	50 %	334139607
131	NC_015580	GCC	2	6	5927	5932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139607
132	NC_015580	CCG	2	6	6081	6086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139607
133	NC_015580	TTG	2	6	6156	6161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334139607
134	NC_015580	TCG	2	6	6324	6329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139607
135	NC_015580	GC	4	8	6381	6388	0 %	0 %	50 %	50 %	334139607
136	NC_015580	CGA	2	6	6442	6447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139607
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138	NC_015580	CTGA	2	8	6536	6543	25 %	25 %	25 %	25 %	334139607
139	NC_015580	CAGC	2	8	6608	6615	25 %	0 %	25 %	50 %	334139607
140	NC_015580	GGC	2	6	6617	6622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139607
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142	NC_015580	GAA	2	6	6709	6714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139608
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246	NC_015580	CGG	3	9	12595	12603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139614
247	NC_015580	CG	3	6	12610	12615	0 %	0 %	50 %	50 %	334139614
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249	NC_015580	GCCGC	2	10	12668	12677	0 %	0 %	40 %	60 %	334139614
250	NC_015580	GAA	2	6	12699	12704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139614
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253	NC_015580	GC	3	6	12803	12808	0 %	0 %	50 %	50 %	334139614
254	NC_015580	CCT	2	6	13031	13036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334139614
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256	NC_015580	GCG	2	6	13140	13145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139614
257	NC_015580	AAG	2	6	13191	13196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139614
258	NC_015580	GC	3	6	13197	13202	0 %	0 %	50 %	50 %	334139614
259	NC_015580	GCG	2	6	13209	13214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139614
260	NC_015580	GATCT	2	10	13377	13386	20 %	40 %	20 %	20 %	334139614
261	NC_015580	CGG	2	6	13400	13405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139614
262	NC_015580	GCC	2	6	13435	13440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139615
263	NC_015580	TG	3	6	13442	13447	0 %	50 %	50 %	0 %	334139615
264	NC_015580	AAC	2	6	13557	13562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334139616
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273	NC_015580	GCCAT	2	10	14053	14062	20 %	20 %	20 %	40 %	334139616
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279	NC_015580	CCT	2	6	14245	14250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
280	NC_015580	TGC	2	6	14299	14304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139617
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389	NC_015580	CGC	2	6	18968	18973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139622
390	NC_015580	CGAT	2	8	19062	19069	25 %	25 %	25 %	25 %	334139622
391	NC_015580	GCA	2	6	19119	19124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139622
392	NC_015580	ACG	2	6	19202	19207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139622
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395	NC_015580	TAT	2	6	19430	19435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
396	NC_015580	ACG	2	6	19509	19514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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497	NC_015580	CGGCG	2	10	24550	24559	0 %	0 %	60 %	40 %	334139626
498	NC_015580	GAA	2	6	24628	24633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139626
499	NC_015580	TGC	2	6	24658	24663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_015580	TGA	2	6	24714	24719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139627

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